Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASKO14936 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASKO14936 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASKO14936 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CASKO14936 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASKO14936 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASKO14936 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASKO14936 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASKO14936 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASKO14936 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASKO14936 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASKO14936 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASKO14936 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASKO14936 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASKO14936 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASKO14936 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASKO14936 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASKO14936 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASKO14936 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASKO14936 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASKO14936 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASKO14936 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASKO14936 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASKO14936 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASKO14936 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASKO14936 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASKO14936 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASKO14936 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASKO14936 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASKO14936 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASKO14936 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASKO14936 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASKO14936 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASKO14936 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASKO14936 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASKO14936 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASKO14936 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASKO14936 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASKO14936 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASKO14936 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASKO14936 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CASKO14936 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms