Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms