Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DFFAO00273 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DFFAO00273 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DFFAO00273 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DFFAO00273 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DFFAO00273 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DFFAO00273 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DFFAO00273 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DFFAO00273 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DFFAO00273 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DFFAO00273 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DFFAO00273 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DFFAO00273 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DFFAO00273 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DFFAO00273 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DFFAO00273 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DFFAO00273 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DFFAO00273 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DFFAO00273 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DFFAO00273 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DFFAO00273 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DFFAO00273 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DFFAO00273 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DFFAO00273 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DFFAO00273 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DFFAO00273 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DFFAO00273 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DFFAO00273 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms