Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT5HO00267 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms