Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAPO00193 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAPO00193 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAPO00193 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAPO00193 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAPO00193 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAPO00193 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAPO00193 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAPO00193 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAPO00193 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAPO00193 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
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SMAPO00193 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAPO00193 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAPO00193 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAPO00193 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAPO00193 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAPO00193 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAPO00193 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAPO00193 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAPO00193 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAPO00193 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAPO00193 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAPO00193 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAPO00193 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAPO00193 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAPO00193 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAPO00193 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAPO00193 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAPO00193 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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