Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARVCFO00192 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms