Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
I3L4J1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
I3L4J1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
I3L4J1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
I3L4J1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
I3L4J1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
I3L4J1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
I3L4J1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
I3L4J1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
I3L4J1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
I3L4J1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
I3L4J1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
I3L4J1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
I3L4J1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
I3L4J1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
I3L4J1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
I3L4J1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
I3L4J1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
I3L4J1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
I3L4J1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
I3L4J1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
I3L4J1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
I3L4J1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
I3L4J1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
I3L4J1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
I3L4J1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
I3L4J1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
I3L4J1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
I3L4J1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
I3L4J1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
I3L4J1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
I3L4J1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
I3L4J1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
I3L4J1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
I3L4J1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
I3L4J1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
I3L4J1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
I3L4J1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
I3L4J1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
I3L4J1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms