Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L21D6R901 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L21D6R901 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms