Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms