Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP27XA6NNY8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP27XA6NNY8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms