Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC85CA6NKD9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85CA6NKD9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms