Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms