Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF316A6NFI3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms