Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT87PA6NCN2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms