Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3AA6NCI4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms