Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC144AA2RUR9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC144AA2RUR9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms