Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIPSLA2A3N6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIPSLA2A3N6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms