Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms