Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLRN2A0PK11 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
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