Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms