Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
MED16Q9Y2X0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED16Q9Y2X0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms