Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDZRN3Q9UPQ7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms