Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms