Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP83

COG5, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG5Q9UP83 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG5Q9UP83 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG5Q9UP83 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms