Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms