Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms