Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms