Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
INO80Q9ULG1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
INO80Q9ULG1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
INO80Q9ULG1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms