Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PALD1Q9ULE6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALD1Q9ULE6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms