Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TSPAN16Q9UKR8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms