Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C4Q9UKN8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3C4Q9UKN8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms