Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms