Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms