Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms