Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA2Q9UJY4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA2Q9UJY4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms