Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCTN4Q9UJW0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN4Q9UJW0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN4Q9UJW0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN4Q9UJW0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN4Q9UJW0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN4Q9UJW0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCTN4Q9UJW0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms