Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms