Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT7Q9UIV1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT7Q9UIV1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT7Q9UIV1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT7Q9UIV1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT7Q9UIV1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT7Q9UIV1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT7Q9UIV1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT7Q9UIV1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT7Q9UIV1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT7Q9UIV1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT7Q9UIV1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT7Q9UIV1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT7Q9UIV1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms