Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO40Q9UH90 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO40Q9UH90 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms