Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms