Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms