Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP2BPQ9P2M1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP2BPQ9P2M1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms