Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL9Q9P2J3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL9Q9P2J3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms