Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
RRBP1Q9P2E9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms