Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms