Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms