Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMG20BQ9P0W2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms