Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VNN3Q9NY84 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms