Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms