Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC6A13Q9NSD5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms